Molybdeenikohteetniillä on laaja valikoima sovelluksia, mukaan lukien, mutta ei rajoittuen:
Puolijohteiden valmistus: Puolijohteiden ja litteiden näyttöjen valmistuksessa molybdeenikohteita käytetään ohuiden kalvokerrosten muodostamiseen sputterointi- tai haihdutustekniikan avulla, jotka ovat elektronisten laitteiden välttämätön osa.
Päällystystekniikka: Molybdeenikohteita voidaan käyttää erilaisissa pinnoitussovelluksissa, mikä tarjoaa erinomaisen suorituskyvyn ja kestävyyden.
Säteilylääketiede: Säteilylääketieteessä molybdeenikohteilla on myös tärkeitä sovelluksia.